2025年3月26日，研究院正式更名為“深圳先進(jìn)光源研究院”。 新名稱更加精準(zhǔn)地聚焦于先進(jìn)光源領(lǐng)域的核心使命，昭示著專業(yè)化、戰(zhàn)略化的新征程。

2025年5月，先進(jìn)光源預(yù)研場地相繼完成驗收并交付使用，科研團隊有序入駐，各項核心技術(shù)攻關(guān)、樣機研制工作同步展開，為深圳自由電子激光項目按計劃推進(jìn)提供了重要的空間保障。

2025年5月，中國科學(xué)院院士楊學(xué)明新當(dāng)選為英國皇家學(xué)會外籍院士；8月，我院殷志斌副研究員獲批國家自然科學(xué)基金青年科學(xué)基金項目（B類），實現(xiàn)我院在該類人才項目領(lǐng)域的突破。全年研究院共新增國家級人才1名，省部級人才2名，區(qū)級高層次人才9名。人才梯隊建設(shè)持續(xù)完善，為科研創(chuàng)新提供堅實人才保障。

2025年7月24日，研究院聯(lián)合團隊成功實現(xiàn)百萬赫茲重復(fù)頻率電子束流貫通實驗。這一里程碑成果，標(biāo)志著團隊已完全掌握產(chǎn)生高品質(zhì)束流的核心關(guān)鍵技術(shù)。

2025年10月22日，深圳先進(jìn)光源研究院入駐綜合樓。標(biāo)志著研究院正式入駐光明科學(xué)城大科學(xué)裝置集群，邁入高質(zhì)量發(fā)展新階段。

2025年10月22日，深圳先進(jìn)光源研究院第二屆理事會第二次會議在研究院綜合樓召開。各位理事圍繞研究院發(fā)展積極建言獻(xiàn)策，為研究院高質(zhì)量發(fā)展貢獻(xiàn)重要智慧。

2025年11月12日，研究院獲批加掛“高校區(qū)域技術(shù)轉(zhuǎn)移轉(zhuǎn)化中心高端科學(xué)儀器深圳分中心”牌子；11月14日，深圳分中心攜23項優(yōu)質(zhì)成果首次亮相第二十七屆中國國際高新技術(shù)成果交易會；12月4日，深圳分中心在光明科學(xué)城論壇主論壇揭牌，并于12月16日在高?？萍汲晒灰讜霞訏臁皣掖髮W(xué)科技園”正式授牌，標(biāo)志著該國家級科技創(chuàng)新平臺基地進(jìn)入實體化運營階段，未來將全力推動高端科學(xué)儀器領(lǐng)域的成果轉(zhuǎn)化與產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用。

12月4日-5日，研究院主辦的大灣區(qū)科學(xué)儀器創(chuàng)新發(fā)展大會成功舉辦。大會旨在發(fā)揮大灣區(qū)優(yōu)勢，推動科學(xué)儀器技術(shù)創(chuàng)新和產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用，提升國產(chǎn)化替代水平和應(yīng)用規(guī)模。